在论文查重软件中，以下几款软件会在检测到抄袭内容时将相关部分标红：

PaperGet：

这款软件提供免费的查重服务，并且有专业版可供选择。它会将检测到的重复内容用红色标注出来。

知网：

国内大多数高校采用知网查重系统，它采用“模糊查询”技术，如果论文结构和大纲被打乱，可能会导致同一部分内容在多次检测中标红不一致。知网也会自动识别参考文献，但参考文献格式错误会导致其被当做正文部分进行查重并标红。

万方：

这是一款价格低廉的查重工具，它会将连续10个字相同的文本视为抄袭，并用红色标注出来。万方对公式定理和参考文献也会进行标红。

PP：

这款查重软件的敏感度较高，连续4字相同即算抄袭，并且会标红各种公式定理。

Gocheck论文检测专家：

该系统支持中英文检测，提供详尽的检测报告，并用红色字体将涉嫌抄袭的内容标出。它还支持高亮文档功能，用户可以直接在Word文档中看到标红部分，便于修改。

学术不端网：

这是一个知网自助查重网站，也提供标红抄袭内容的查重服务。

建议选择适合个人需求的查重软件，并确保参考文献格式正确，以获得准确的查重结果。