组织机构使用的软件主要有以下几种：

Visio：

这是一款由微软公司开发的 专业绘图软件，适用于制作组织结构图。用户可以通过在Shapes窗口拖拽各种图元来创建箭头、文字等，并根据需求进行编辑。Visio还支持复杂的结构绘制和关系定义，同时具备丰富的图表模板和预定义符号，使其成为制作专业组织架构图的理想工具。

迅捷画图：

这是一款 在线画图工具，支持实时保存和云端存储，用户可以在网页上直接展示或通过文件夹分类管理脑图。迅捷画图拥有多种脑图类型，包括组织结构图，并提供多样化的设计元素和大量图标，满足不同的风格和需求。此外，它还支持多人协作和分享，适合团队协作和项目管理。

亿图组织架构管理软件OrgCharting：

这是一款企业级的组织架构管理软件，通过数据和组织架构图的双向交互，简化了创建和维护公司人力资源配置和公司层级架构的任务。该软件内置了专业的架构图模板和相关案例，帮助新手快速创作出精美的组织架构图，并支持自动创建和更新。

这些软件各有特点，用户可以根据自己的需求和习惯选择合适的工具来制作和组织机构图。