将文件存储在非系统盘（如D盘、E盘等）中是最佳实践。系统盘（通常是C盘）用于存储操作系统和关键系统文件，而将其他文件存储在非系统盘可以避免在系统崩溃或重装时数据丢失的风险。此外，非系统盘的空间通常比系统盘大，有助于提高电脑的性能，因为系统运行时对磁盘的读写操作较少。

具体建议如下：

避免C盘：

尽量不要将文件存储在C盘，除非是必要的系统文件或程序安装。

分类存储：

在非系统盘中，可以根据文件类型或使用频率进行分类存储，如D盘存放应用软件，E盘存放游戏，F盘存放影音图片，G盘存放工作资料等。

备份重要数据：

定期备份重要文件，以防意外丢失。

使用固态硬盘（SSD）：

如果条件允许，可以将固态硬盘作为系统盘（C盘），以提高系统启动和运行速度，同时使用机械硬盘（HDD）作为数据存储盘。

遵循这些建议，可以确保文件的安全性和电脑的高效运行。