处理TEM（透射电子显微镜）数据的软件主要有以下几种：

DigitalMicrograph （DM）

由Gatan公司开发，是最常用的TEM数据分析软件，用于处理和分析TEM图像和谱图，以及挖掘更深入的关键信息。

支持图像采集、处理和数据分析，能够对目标物进行更准确的定点定位、化学研究，同时还能对分析报告进行打印等。

PyTEM

是一个Python库，专门用于处理透射电镜（TEM）数据。

可以读取和处理DM3格式的TEM图像，提供去噪、对比度增强等功能，并且建议先安装numpy和scipy库以获得更好的处理效果。

ImageJ

是一个开源的图像处理软件，也可以用于打开和编辑TEM图文件。

maxwell, Emigma, IX1D

这些是早期的TEM图像处理软件，但它们的权威性和使用频率已经不如DigitalMicrograph和PyTEM。

建议

对于常规的TEM图像处理和分析，建议使用DigitalMicrograph，因为它功能全面且用户群体广泛。

对于需要编程处理TEM数据的研究人员，PyTEM是一个非常好的选择，它利用Python语言的高效性和灵活性，可以大大简化数据处理流程。

对于简单的图像查看和编辑，可以考虑使用ImageJ，它是一个开源且功能强大的图像处理工具。