修改图层的软件包括以下几种：

Adobe Photoshop：

这是最知名和功能最强大的图像处理软件之一，提供了丰富的图层编辑功能，包括图层管理、滤镜、调整色彩和亮度等。

Fireworks 8：

除了Photoshop，Fireworks 8也可以修改图片图层。

GIMP：

这是一款免费的开源图像编辑软件，支持图层编辑、高级选择工具、滤镜和脚本等功能，适合需要更多控制权的用户。

Blendbox Alpha：

这款软件引入了图层功能，可以调整纹理、光影、色彩和移动对象，提供了前所未有的自由度。

浩辰CAD：

在浩辰CAD软件中，有CAD图形变换工具可以帮助进行图层设置和修改。

迅捷拼图助手：

这是一个图形设计工具，具有简单的界面和大量的模板，适用于创建社交媒体图像、名片、海报等，也提供了文本和图形效果。

Snapseed：

由Google开发的免费移动应用，提供了广泛的图像编辑功能，包括调整、旋转、裁剪、滤镜、饱和度和局部调整等。

Pixelmator：

面向专业操作者的图片编辑软件，具备强大的画图和修图功能，可以轻松调整图片的每一个细节。

根据你的需求和操作习惯，可以选择合适的软件来修改图层。对于专业设计师和需要高级编辑功能的用户，Adobe Photoshop和GIMP是理想的选择。对于需要快速编辑和简单设计的用户，可以尝试使用Fireworks 8、Blendbox Alpha、Snapseed或迅捷拼图助手。