ADTech指的是一系列 分子对接及结果分析辅助软件,其中最主要的工具是 AutoDockTools (ADT)。
AutoDockTools (ADT):
由Scripps研究所的Molecular Graphics Laboratory (MGL)开发。
在Python Molecular Viewer (PMV)基础上开发,提供图形化的分子可视化及对接辅助功能。
支持AutoDock和AutoGrid程序,最新版本为1.5.2。
主要功能包括:
PMV菜单:通过菜单命令对分子进行操作和可视化设置。
PMV工具栏:常用命令的快捷按钮。
ADT菜单:AutoGrid和AutoDock的图形化操作菜单。
分子显示窗口:3D模型分子的显示和操作窗口。
仪表板窗口部件:快速查看及设置分子的显示模型和着色方式。
信息栏:显示相关操作信息。
AutoDock Vina:
由MGL实验室开发,是AutoDock 4.0的改进版。
提高了结合模式预测的平均准确度,使用更简单的打分函数加快搜索速度。
能够处理约20个可旋转键的体系,并提供重现性较好的对接结果。
PyRx:
基于AutoDock 4.0及以上版本或AutoDock Vina的虚拟筛选工具。
提供简单易用的对接插件,适用于计算机辅助药物设计。
包含表单功能和可视化引擎。
这些软件主要用于分子对接、虚拟筛选和药物设计等领域,提供了强大的图形化界面和自动化工具,极大地方便了研究人员和药物设计师的工作。