软件工程研究所主要学习的课程包括但不限于以下内容：

程序设计语言：

如《C/C++程序设计》、《Java语言程序设计》等。

数据结构与算法：

涵盖数据结构、算法分析等基础知识和应用。

操作系统：

如《Linux操作系统与网络编程》等。

数据库系统：

包括《数据库开发技术》、《数据库原理与实现技术》等。

软件工程基础：

如《软件工程》、《软件工程概论》等，学习软件开发的工程化方法和过程。

编译技术：

涉及编译原理、汇编语言程序设计等。

网络与编程：

如《计算机网络》等。

设计模式与架构：

学习软件体系结构、统一建模语言（UML）等。

软件测试与维护：

包括《软件测试技术》、《软件维护》等。

人工智能与大数据：

如《人工智能技术》、《大数据》等。

项目管理：

学习软件项目管理、项目估算与进度控制等。

计算机安全：

涉及计算机安全原理和技术。

此外，软件工程研究所还可能提供一些选修课程或专业方向，如JAVA、大数据、云计算、软件设计、数字媒体、金融软件开发、嵌入式应用开发、软件开发与测试、移动互联网开发、移动设备应用开发等。

建议根据具体的研究方向和兴趣选择相关课程，同时加强实践能力的培养，以便更好地适应软件工程领域的实际需求。