动画制作中常用的特效软件有以下几种：

Adobe After Effects （AE）

AE是一款专业的视频合成特效制作软件，广泛应用于MG动画制作。它具有强大的合成、关键帧、路径等功能，并且支持多种插件，可以实现复杂的特效效果。

万彩特效大师

万彩特效大师适合新手入门，操作简便，渲染速度快，且不需要学习复杂的插件操作。它内置了丰富的特效素材和模板，能够满足大部分创作需求。

Blender

Blender是一款免费且功能强大的开源3D动画制作软件，适合制作高质量的动画、建模和渲染。虽然界面较为复杂，但其内置的工具和免费性使其成为许多广告和影视创作者的首选。

Synfig Studio

Synfig Studio是一款2D动画开发程序，适合制作高质量的2D动画。它配备了专业的骨骼系统，适合创建高级的动画角色和动态效果，但上手难度较大。

Houdini

Houdini由Side Effects Software Inc.开发，是一款用于创建高级视觉效果的工具，广泛应用于电影特效制作。其强大的节点式合成系统使得特效制作非常灵活和高效。

Nuke

Nuke由The Foundry公司研发，是一款数码节点式合成软件，能够将最终视觉效果与电影电视的其余部分无缝结合，适用于各种复杂特效的制作。

Cinema 4D （C4D）

Cinema 4D是一款流行的三维动画制作软件，广泛应用于广告、影视和游戏开发等领域。它以高效的工作流程和强大的渲染能力著称。

Autodesk Maya

Maya是Autodesk公司出品的世界顶级三维动画软件，功能强大，适用于专业的影视广告、角色动画和电影特技。其高昂的售价和强大的功能使其成为制作者梦寐以求的工具。

3D Studio Max （3ds MAX）

3ds MAX是Autodesk公司开发的另一款流行的三维动画制作软件，广泛应用于建筑设计、三维动画和音视制作等领域。它以图形化的操作界面和强大的功能著称。

Toon Boom Harmony

Toon Boom Harmony是一款专业级动画软件，提供广泛的功能，包括手绘、骨骼动画、粒子系统和3D合成，适合迈向专业动画制作的用户。

Anime Studio

Anime Studio是一款适合中级动画制作的软件，提供基本的手绘和骨骼动画功能，支持复杂的动画控制、特效、过渡和场景设计。

Flash

Flash（现更名为Adobe Animate）是Adobe公司开发的多媒体动画软件，适用于创建Web动画和视频内容。它包含各种图形设计和绘图工具，适合快速创建具有自然运动流畅的动画。

根据以上信息，选择合适的特效软件需要根据具体需求和技能水平来决定。对于新手来说，万彩特效大师和Blender是不错的选择；对于追求更高制作质量和效率的专业人士，则可以考虑AE、Houdini、Nuke和Maya等软件。