波音公司使用的系统软件主要有以下几种：

VxWorks

波音-787和AH-64使用的操作系统是VxWorks。VxWorks是一个实时操作系统（RTOS），支持通过容器部署应用程序，具有强大时间和空间分区功能，适用于多种多核处理器平台。

Integrity-178B

B-2、F-16、F-22、F-35和空客-380使用的操作系统是Integrity-178B。Integrity-178B是一个安全性极高的实时操作系统，用于关键任务系统，具有严格的安全认证和完整性保护机制。

这些系统软件在波音的不同机型中发挥着重要作用，确保飞行器的安全、可靠和高效运行。