软件企业在进行会计核算时，应遵循以下步骤和原则：

根据业务发生情况做分录

计提工资时，借：研发支出等科目，贷：应付职工薪酬—工资。

取得收入时，借：银行存款等科目，贷：主营业务收入，应交税费—应交增值税（销项税额）。

结转成本时，借：主营业务成本，贷：库存商品。

账务处理

缴纳上月流转税，借：应交税金-未交增值税，贷：银行存款。

收到退还的增值税，借：银行存款，贷：补贴收入。

销售软件，借：银行存款，贷：产品销售收入--软件产品，应交税金--应交增值税（销项税额）。

软件培训收入，借：现金或银行存款，贷：主营业务收入-培训收入。

外购原材料，借：原材料，应交税金--应交增值税（进项税额），贷：银行存款。

发生费用，借：管理费用或销售费用或营业费用，贷：现金或银行存款。

发放工资，借：应付职工薪酬，贷：银行存款。

期末处理

月末进行计提、摊销、结转记账凭证，编制记账凭证汇总表，登记总账。

结账、对账，确保账证相符、账帐相符、帐实相符。

编制会计报表，包括资产负债表、利润表、现金流量表和所有者权益变动表，并进行分析说明。

税金申报缴纳

每月月末计算提取相关税金，如增值税、城建税、教育费附加等。

按时申报缴纳个人所得税、增值税、所得税等。

年终进行所得税汇算清缴。

成本核算

对各部门直接发生的成本费用进行直接归集。

对共同承担的费用按比例分配到各部门。

辅助部门成本费用按直接生产部门工时数比例分配。

项目成本按项目工时总数占各项目合计工时总数比例分配。

会计软件使用

选择合适的财务软件，如金蝶、用友、速达等。

在财务软件中建立账套，输入企业基本信息、会计制度、人员设置、纳税性质等。

设置科目和辅助核算，录入期初余额，设置凭证种类并录入凭证。

审核凭证，确保凭证正确性。

记账、结账，生成财务报表。

财务分析与决策

进行财务预测和决策，编制财务预算。

进行财务控制和分析，评价业绩。

通过以上步骤和原则，软件企业可以有效地进行会计核算，确保财务信息的准确性和及时性，为企业的经营管理提供有力的财务支持。