软件判断论文相似度主要基于以下几种方法和技术：

内容相似度检测

文本比对：将待检测论文的文本分成多个段落或句子，并与数据库中的文本进行逐段或逐句比对。常见的比对策略包括字符比对和字符串匹配算法。

自然语言处理（NLP）技术：使用分词、词性标注、句法分析等NLP技术对待检测论文和已有文献进行预处理，然后计算两者之间的相似度。常见的相似度计算算法包括余弦相似度、Jaccard相似系数等。

文献引用检测

自动识别参考文献：软件会自动识别待检测论文中的参考文献，并与已有文献数据库进行比对，查看是否存在引用过多或者未经引用的情况。

其他因素考虑

排版、图片和表格的重复：除了文本内容，软件还可能考虑论文的排版、图片和表格的重复情况，以全面评估论文的原创性。

相似度报告

生成相似度报告：软件会生成一个详细的相似度报告，显示目标文本与已有文本之间的相似度百分比，并标出相似部分，帮助用户了解具体哪些部分存在相似问题。

比对数据库

已有文献数据库：软件通常包含各种学术论文、期刊、书籍和互联网上的文本资源，作为比对的数据库。

用户界面和体验

直观的用户界面：一些软件提供直观的用户界面，使用户可以轻松上传文本文件或直接输入文字进行检测。

快速检测速度：软件通常具有快速的检测速度，几秒钟内即可完成检测，提高工作效率。

免费与付费工具

免费工具：如Google Docs的作文工具、PlagScan、Word sense、Ahrefs等，提供基本的相似度检测功能。

付费工具：如维普查重软件、福昕论文助手等，提供更为全面和专业的查重服务，支持多种查重模式和智能推荐功能。

通过上述方法和技术，软件能够有效地判断论文的相似度，帮助用户发现潜在的抄袭问题，维护学术诚信。建议用户在撰写论文时，使用可靠的查重工具进行辅助，确保论文的原创性和学术质量。