重要文件应该放在非系统盘，如D盘、E盘或F盘等，以避免在系统重装时数据丢失。C盘通常用于安装操作系统和运行常用程序，因此将重要文件存放在C盘存在一定风险。以下是一些具体的建议：

D盘：

可以用于存放软件安装和重要资料。许多用户习惯将D盘作为软件安装盘，同时也可以存放一些重要的文档和资料。

E盘：

建议用于存放重要文件，包括论文、参考文献、项目文件等。一些用户还会将重要文件备份到云端，如百度网盘，以提高数据安全性。

F盘：

可以用于存放其他资料，如照片、视频、音乐等。有些用户会在F盘创建专门的文件夹来管理这些内容。

桌面：

虽然桌面方便访问，但桌面上的文件实际上储存在C盘，因此不建议将重要文件放在桌面。如果确实需要放在桌面，建议创建一个桌面文件夹，并将文件存储在非系统盘中，然后通过桌面快捷方式访问。

备份：

除了将重要文件存放在非系统盘外，还建议定期备份到移动硬盘或光盘等外部存储设备，以防意外丢失。

综上所述，将重要文件存放在非系统盘（如D盘、E盘或F盘）是较为安全和合理的选择。同时，定期备份文件到外部存储设备可以进一步提高数据的安全性。