将文件存储在非系统盘（如D盘、E盘或F盘）中是相对安全的做法。系统盘（通常是C盘）主要用于安装和运行操作系统，如果系统出现问题需要重装，系统盘上的数据将会丢失。因此，避免将重要文件存储在C盘可以防止在系统重装时数据丢失的风险。

此外，虽然D盘、E盘和F盘等非系统盘提供了较大的存储空间，但为了进一步提高数据安全性，建议定期将重要文件备份到移动硬盘或光盘上。这样即使遇到硬盘故障或其他数据丢失情况，也能有效保护数据安全。

综上所述， 将文件存储在非系统盘，并定期备份到其他存储介质，是既安全又可靠的做法。