将文件存储在电脑的非系统盘（如D盘或E盘）中是 推荐的做法。原因如下：

系统盘（C盘）主要用于存储操作系统、驱动程序、系统更新和插件等关键文件。如果这些文件与其他数据混合存储，一旦系统需要重装，所有数据都将被删除。

非系统盘的分区（如D盘和E盘）可以独立于系统盘，便于数据管理和备份。将常用软件、工具、游戏、电影和音乐等数据存放在这些分区中，可以保持系统的整洁和快速启动。

将数据存储在非系统盘还可以提高系统的整体性能。由于系统盘通常需要保留一定的空间用于系统运行，将数据分散存储在其他分区可以避免C盘过度拥挤，从而提高系统的响应速度。

对于重要数据，建议进行额外备份。可以使用移动硬盘或U盘等外部存储设备进行备份，以确保数据的安全性和可靠性。

综上所述，为了保障数据的安全性和系统的稳定性，建议将常用文件和数据存储在非系统盘（如D盘或E盘），并对重要数据进行定期备份。