将文件存储在电脑的非系统盘（如D盘、E盘或F盘）中是相对安全的。系统盘（通常是C盘）主要用于存储操作系统和系统文件，如果系统出现问题需要重装，系统盘上的数据可能会丢失。因此，为了避免在系统重装时丢失重要文件，建议将文件存储在非系统盘中。

此外，对于重要文件，可以考虑备份到其他存储设备上，如移动硬盘或光盘，以提高数据的安全性。

总结来说，为了确保文件的安全性，建议将文件存储在非系统盘中，并定期备份重要数据。