水声工程中常用的软件包括：

MATLAB

MATLAB是一种强大的数学计算软件，广泛应用于水声工程中的信号处理、声学建模和仿真。它提供了丰富的工具箱和函数库，可以进行声学模拟、波束形成、信道建模、噪声分析等。

C/C++

C/C++是一种较为底层的编程语言，适用于实时音频处理和控制。在水声工程中，C/C++可以用于编写实时声波传播模型、滤波算法和噪声消除算法等。其优点包括高效性、灵活性和可移植性。

Python

Python是一种高级编程语言，具有简洁易读的语法和丰富的科学计算库。在水声工程中，Python可以用于信号处理、数据分析、图像处理等各个方面。

Simulink

Simulink是MATLAB的一个扩展工具箱，用于建立和模拟动态系统的模型。它也可以用于水声工程的系统建模和仿真。

Bellhop

Bellhop是水声信道仿真软件，可以防止声波在水声传播的损失和反射情况。

此外，还有一些特定领域的软件工具，比如SonarWiz和HYDRODARE等专门用于水声测量和海洋工程的软件。

建议根据具体需求选择合适的软件工具，以提高水声工程的工作效率和准确性。