Cytoscape是一款 用于分析和可视化生物网络的开源软件。它广泛应用于生物信息学领域，具有以下主要功能：

构建和可视化生物分子间的相互作用网络：

包括蛋白质互作网络、基因调控网络、代谢途径等，帮助研究人员理解生物分子的复杂关系。

提供丰富的网络分析工具：

能够识别关键节点、子网络、模块等，发现潜在的生物学意义和治疗靶点。

集成多种生物信息学数据：

实现多维度分析，满足用户在不同研究领域中的需求。

强大的插件系统：

支持用户根据需求安装不同的插件，扩展软件的功能。

Cytoscape支持多种数据格式，用户可以轻松导入数据，并通过直观的界面构建和定制网络图形。它还提供多种布局算法，使网络呈现更合理美观，并具备分析功能，如计算节点度等属性。

此外，Cytoscape源自系统生物学，专门用于将生物分子交互网络与高通量基因表达数据和其他分子状态信息整合在一起，其最强大的功能在于大规模蛋白质-蛋白质相互作用、蛋白质-DNA和遗传交互作用的分析。

综上所述，Cytoscape是一款功能强大的生物信息学软件，广泛应用于生物网络的构建、分析和可视化，是研究人员探索生物分子复杂关系的重要工具。